Konttitalojen rakennuskustannukset ja{0}}pitkän aikavälin käyttökustannukset ovat aina olleet suuri huolenaihe. Tutkijat tekivät kattavia laskelmia eri eristysmateriaalien kokonaiskustannuksista niiden koko elinkaaren ajalta ja löysivät mielenkiintoisia ilmiöitä: vaikka paksumpia eristekerroksia tarvitaan korkealla-korkeudessa, tämä ei välttämättä tarkoita parempaa kustannustehokkuutta{3}}. Erinomaisista eristysominaisuuksistaan huolimatta eräitä korkean teknologian eristemateriaaleja (kuten airgel-tyhjiöpaneelit) on vaikea ottaa laajalti käyttöön niiden korkean hinnan vuoksi.
On huomionarvoista, että suunnittelun optimointi tieteellisten laskentamenetelmien avulla ei voi pelkästään vähentää rakennuskustannuksia, vaan myös vähentää merkittävästi myöhempiä energiankulutuskustannuksia. Tämä kokonaisvaltainen optimointitapa tekee konttitaloista kilpailukykyisempiä kustannustehokkuuden suhteen-, mikä tukee vahvasti niiden laajaa käyttöönottoa. Nämä havainnot tarjoavat käytännön referenssejä konttitalojen taloudelliseen suunnitteluun-, kun otetaan huomioon sekä alkuinvestointi että huolellinen pitkän aikavälin käyttökustannusten laskeminen.